Le rôle de coordination de l'AMA la place dans une position unique pour planifier son programme de contrôles hors compétition. Ce programme vise à cibler des sportifs d'élite dans des régions du monde où peu de contrôles ou aucun contrôle ne sont effectués actuellement, ainsi que dans des sports olympiques ou reconnus qui ne disposent pas encore d'un programme de contrôles hors compétition important. Le programme de l'AMA donne la possibilité à des sportifs qui ne sont pas soumis à des contrôles normalement de prouver qu'ils ne font pas usage de produits dopants. Il implique également que tous les sportifs d'élite peuvent potentiellement être contrôlés, quels que soient leur sport et leur emplacement géographique.

L'AMA ne veut pas remplacer les programmes de contrôles existants. Au contraire, l'Agence encourage les organisations antidopage à réaliser davantage de contrôles. Le programme de l'AMA complète les programmes existants en étant entièrement indépendant des fédérations sportives et des divers pays. A travers son programme de contrôles hors compétition inopinés, l'AMA vise à protéger le droit des athlètes de concourir dans un environnement sans dopage, et à donner confiance aux athlètes et au public.

L'AMA a créé des accords de partenariat avec des agences telles que des agences nationales antidopage pour la collecte des échantillons, ainsi qu'avec des laboratoires accrédités pour l'analyse des échantillons. La planification des contrôles et la coordination sont effectuées par le bureau principal de l'AMA. Les échantillons d'urine et de sang sont collectés conformément aux règles et règlements des Fédérations sportives concernées, qui sont également responsables de la gestion des résultats.

En 2003, l'AMA a conclu ou renouvelé des accords avec 26 des 28 Fédérations internationales olympiques de sports d'été, et avec les 7 Fédérations internationales olympiques d'hiver. En outre, l'AMA a signé des accords avec 6 FI reconnues.

En 2003, l'AMA a collecté un total de 5004 échantillons : 4229 d'urine et 775 de sang. Beaucoup des échantillons d'urine ont été analysés pour détecter la présence d'EPO et des autres produits habituellement recherchés. Le programme 2003 a donné lieu à 28 résultats d'analyses anormaux et à 3 refus.